Vad används NCBI BLAST till?
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) hittar regioner med lokal likhet mellan protein- eller nukleotidsekvenser. Programmet jämför nukleotid- eller proteinsekvenser med sekvens i en databas och beräknar den statistiska signifikansen av matchningarna.
Är NCBI BLAST en programvara?
År 1990 släppte forskare vid National Center for Biotechnology Information (NCBI) ett nytt mjukvarupaket för snabb jämförelse av DNA och proteinsekvens [15].
Hur hittar du BLAST?
BLAST -sekvenslikhetssökning
- Välj fliken 'Blast' i verktygsfältet högst upp på sidan för att köra en sekvenslikhetssökning med Blast -programmet.
- Ange antingen en protein- eller nukleotidsekvens eller en UniProt -identifierare i formulärfältet (Figur 37).
- Klicka på knappen "Kör sprängning".
Vad är NCBI GenBank?
GenBank® är en omfattande databas som innehåller offentligt tillgängliga nukleotidsekvenser för mer än 300 000 organismer som är namngivna på släktnivå eller lägre, främst erhållna genom inlämningar från enskilda laboratorier och batchinsändningar från storskaliga sekvensprojekt, inklusive hela genom-hagelgevär ( ...